Zakład Mikrobiologii Klinicznej

Kierownik: Dr n. farm. Iwona Żak

( +48 12 3339700; wew. 4700)

Z-ca kierownika: mgr Iwona Sowa-Sierant

Sekretariat:

Telefon:  +48 12 3339702; wew. 4702,

email: mikrobiologia@usdk.pl

Pracownia Rejestracji i Siania Materiałów, Pracownia Diagnostyki Molekularnej: +48 12 3339704; wew.4704

Pracownia Bakteriologii Ogólnej: +48 12 3339945; wew. 4945

Pracownia Zakażeń Płynów Ustrojowych:  +48 12 3339703; wew. 4703

Pracownia Pałeczek Jelitowych, Pracownia Mykologii, Pracownia Beztlenowców: +48 12 3339946; wew. 4946

Pracownia Wirusologii i Serologii: +48 12 3339944; wew. 4944

Zakład Mikrobiologii Klinicznej to szerokoprofilowe laboratorium mikrobiologiczne, wyposażone  w nowoczesną aparaturę diagnostyczną. Specjalistyczny sprzęt pozwala na wykonywanie około 100 tys. różnych procedur diagnostycznych rocznie, głównie dla potrzeb jednostek organizacyjnych Szpitala, ale też dla kontrahentów zewnętrznych. Certyfikaty potwierdzające udział Zakładu w szeregu krajowych i międzynarodowych programów kontroli zewnętrznej (m.in. POLMICRO, LABQUALITY, INSTAND, QCMD, nadzór prowadzony przez ECDC) oraz wyspecjalizowany personel są gwarantem realizacji badań na wysokim poziomie.

Zakład współuczestniczy w realizacji projektów naukowych, m.in:

• z Krajowym Ośrodkiem Referencyjnym ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów w Warszawie (KORLD)
• z Krajowym Ośrodkiem Referencyjnym ds. Diagnostyki Zakażeń Ośrodkowego Układu Nerwowego w Warszawie (KOROUN)
• z europejską siecią EARS-Net, w ramach której monitorowane są trendy zmian w lekowrażliwości szczepów bakterii izolowanych z krwi i płynu mózgowo-rdzeniowego z ośmiu gatunków istotnych dla epidemiologii zakażeń w szpitalach. Dane zbierane w sieci EARS-Net są przekazywane do systemu monitorowania WHO GLASS.

W strukturze Zakładu funkcjonują  Pracownie:

1. Pracownia Rejestracji i Posiewów Materiałów – przyjmuje i weryfikuje przydatność materiałów klinicznych do wykonania badania, a następnie dokonuje ich posiewów. Zajmuje się również szybką diagnostyką mikrobiologiczną (panele multipleksowe).
2. Pracownia Bakteriologii Ogólnej – wykonuje badania oparte o klasyczne techniki hodowli; wykorzystuje w procesie diagnostycznym konwencjonalne i automatyczne (m.in. spektrometrię masową) metody identyfikacji oraz oznaczania lekowrażliwości drobnoustrojów izolowanych z różnorodnych materiałów; prowadzi również badania w kierunku nosicielstwa szczepów wysokoopornych z alertowymi mechanizmami oporności.
3. Pracownia Zakażeń Płynów Ustrojowych – zajmuje się nadzorem nad zakażeniami krwi, płynów mózgowo-rdzeniowych i płynów dializacyjnych przy użyciu analizatorów nowej generacji, prowadzących stały, 24-godzinny monitoring badanych próbek. W razie wykrycia zakażenia możliwa jest szybka identyfikacja czynnika etiologicznego dzięki zastosowaniu diagnostyki molekularnej.
4. Pracownia Pałeczek Jelitowych – zajmuje się diagnostyką zakażeń związanych z przewodem pokarmowym, wykonując badania w kierunku określonych patogenów (Salmonella, Shigella, Yersinia, Aeromonas); prowadzi również badania w kierunku nosicielstwa szczepów wysokoopornych z alertowymi mechanizmami oporności.
5. Pracownia Mykologii – prowadzi badania związane z diagnostyką zakażeń grzybiczych w różnych materiałach klinicznych, w tym również badania w kierunku dermatofitów; zajmuje się także diagnostyką mykoserologiczną (badania umożliwiające wykrycie zakażeń inwazyjnych powodowanych przez grzyby z rodzajów: Aspergillus spp, Candida spp, Cryptococcus spp).
6. Pracownia Beztlenowców – zajmuje się diagnostyką zakażeń o etiologii Clostridioides difficile, Campylobacter spp; wykrywa metodą hodowli inne drobnoustroje beztlenowe w różnych materiałach klinicznych.
7. Pracownia Diagnostyki Molekularnej – badania te są uzupełnieniem klasycznej diagnostyki mikrobiologicznej, do ich wykonania wykorzystuje się metodę Real Time PCR, charakteryzującą się wysoką czułością i swoistością. Pracownia prowadzi diagnostykę w systemie otwartym (wykrywanie materiału genetycznego wirusów: CMV, EBV, HSV1/2, VZV, BKV, HHV6/7/8, adenowirusa) oraz w systemie zamkniętym (wykrywanie materiału genetycznego różnych drobnoustrojów na panelach multipleksowych, mających zastosowanie do diagnostyki zakażeń układu nerwowego, układu oddechowego i układu pokarmowego). Nowością jest możliwość wykrywania materiału genetycznego wybranych drobnoustrojów bezpośrednio w krwi pacjenta przy zastosowaniu metody rezonansu magnetycznego.
8. Pracownia Wirusologii i Serologii – wykonuje badania serologiczne w kierunku: WZW B, WZW C, CMV, EBV, HSV, Rubella, Toxoplasma gondii, Mycoplasma pneumoniae, Borrelia (testy przesiewowe i testy potwierdzenia), Parwowirus B19 i SARS-CoV-2. W Pracowni wykrywa się również antygeny rotawirusa, norowirusów genogrupy I i II, adenowirusa oraz antygeny wirusów pneumotropowych w ramach szybkich testów diagnostycznych; oznacza się również poziom antystreptolizyny (ASO).
9. Pracownia Pożywek – poprzez przygotowywanie specjalistycznych, komercyjnie trudno dostępnych/niedostępnych podłóż dba o odpowiednie zabezpieczenie diagnostyczne wszystkich Pracowni funkcjonujących w Zakładzie Mikrobiologii Klinicznej.
10. Pracownia Zakażeń Szpitalnych – zajmuje się nadzorem nad sytuacją epidemiologiczną Szpitala, zwracając szczególną uwagę na wysokooporne szczepy drobnoustrojów z alertowymi mechanizmami oporności. Przygotowuje raporty o bieżącej sytuacji poszczególnych oddziałów oraz mapy mikrobiologiczne, które pozwalają przewidywać trendy zmian lekooporności i opracowywać schematy terapeutyczne dla leczonych w Szpitalu zakażeń.

Zakład Mikrobiologii Klinicznej bierze czynny udział w pracach Zespołu ds. Antybiotykoterapii oraz Zespołu Terapeutycznego; współpracuje z Zespołem ds. Farmakoterapii, Zespołem Kontroli Zakażeń Szpitalnych oraz Apteką Szpitalną. W Zakładzie prowadzone są staże specjalizacyjne dla lekarzy w trakcie specjalizacji z: mikrobiologii lekarskiej, chorób zakaźnych, periodontologii i okulistyki, oraz dla diagnostów laboratoryjnych w trakcie specjalizacji z mikrobiologii medycznej; w ramach Praktycznej Nauki Zawodu
w laboratorium praktyki odbywają studenci III i IV roku analityki medycznej Wydziału Farmaceutycznego UJCM.

Personel Zakładu stale podnosi swoje kwalifikacje, uczestnicząc w różnych szkoleniach, warsztatach, sympozjach naukowych oraz konferencjach.  Wysoki standard pracy oraz szeroki zakres prowadzonych badań diagnostycznych jest silnym wsparciem dla oddziałów klinicznych i poradni Szpitala.